Generar, aplicar y difundir conocimientos en ciencia y tecnología de alimentos para la comunidad académica, el sector agroalimentario y la sociedad, desarrollando procesos interdisciplinarios de investigación, docencia y extensión con pertinencia y calidad, que contribuyan al cumplimiento de los objetivos de desarrollo sostenible.

En el 2034 el ICTA será el centro de investigación y de extensión en ciencia y tecnología alimentos más importante de la Universidad Nacional de Colombia y de la región en el desarrollo de nuevos productos y procesos, aseguramiento de la calidad, aplicación de tecnologías emergentes y evaluación nutricional de productos alimenticios, además de ser reconocido como actor del Sistema de Ciencia, Investigación y Tecnología del país por sus contribuciones al cumplimiento de los objetivos del desarrollo sostenible.